遥感飞机的主要任务是充分利用遥感飞机先进的技术性能与我院研制的机载遥感技术系统配套组合，形成科学院机载空间遥感信息获取技术的综合优势，为国家和产业部门及地方提供广泛的航空遥感技术与应用服务。发挥遥感飞机在国民经济建设中的重要作用，并积极参与国际合作，提高科学院航空遥感技术在国内外的地位和水平。

中科院对地观测中心航空遥感中心是负责遥感飞机的运行与管理的机构，实行主任负责制，下设运行管理部、光学系统工程部、微波系统工程部、数据预处理部、飞机工程部。遥感飞机的空地勤人员由海军航空兵配备一个飞行中队的建制，保障飞机的飞行。北京良乡机场是遥感飞机的停放与日常保养维护的基地。

两架遥感飞机中，一号机重点用于光学遥感，可安装多光谱扫描仪、航空相机等传感器；二号机侧重于微波遥感飞机，安装了合成空径雷达及微波辐射计等专门设计的天线罩，同时可兼顾遥感摄影；遥感飞机还可安装大气采样挂架、GPS接收机、机-地实时传输系统。

遥感飞机的运行负责人由航空遥感中心主任王尔和研究员担任。